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Perfil investigador
Eng
Dr. José Félix Aguirre Garrido

Profesor Titular de Carrera Nivel C de Tiempo Completo
Departamento de Ciencias Ambientales

División de Ciencias Biológicas y de la Salud


Nivel I
del
SNII.
Área VII Ciencias de Agricultura, Agropecuarias, Forestales y de Ecosistemas



Unidad Lerma

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Incidencia en los ODS ONU

• 2 Hambre cero

• 6 Agua limpia y saneamiento

• 13 Acción por el clima

• 14 Vida submarina


Intereses de investigación

• Caracterización de comunidades microbianas en sistemas de remediación
• Genómica y metagenómica en ambientes hipersalinos
• Microbiología molecular en la rizosfera de cactus en zonas semiáridas
• Metagenómica microbiana en corales con síndrome blanco
• Diversidad y estructura de comunidades microbianas en especies acuáticas

Semblanza

El Doctor Aguirre-Garrido es Profesor Investigador Titular C Tiempo Completo en la Universidad Autónoma Metropolitana, Unidad Lerma, en el departamento de ciencias ambientales. Por su experiencia en investigación y trayectoria académica, el Dr. Aguirre-Garrido es Investigador Nacional Nivel I del Sistema Nacional de Investigadores, nombramiento vigente hasta el 31 diciembre de 2021.

Su trabajo de investigación está soportado por un total de 12 publicaciones, un índice h de 5 y 112 citas según la base de datos Scopus. Es coautor de 2 capítulos de libros, ha presentado cerca de 15 trabajos en eventos académicos internacionales, 20 trabajos en congresos nacionales e impartido dos cursos de bioinformática uno en la Universidad Autónoma del Estado de México y otro en la Universidad Autónoma Metropolitana.

Ha impartido 5 cursos de conservación de ecosistemas marinos e impacto ambiental en la Unidad Lerma en el marco del convenio que sostiene con la ONG Sea Shepherd. En el periodo de enero 2014 a enero de 2015, hizo una estancia postdoctoral en la Estación Experimental del Zaidín dependiente del Centro Superior de Investigaciones Científicas de España, en el grupo de investigación de Estructura, Dinámica y Función de Genomas de Rizobacterias, durante esta estancia se relacionó con la operación del equipo de secuenciación masiva del centro y el análisis bioinformático de los proyectos asignados al grupo de investigación.

La linea de investigación principal del Dr. Aguirre es la caracterización de comunidades microbianas mediante enfoques de microbiología tradicional y molecular en diferentes ambientes.



Información proporcionada por el personal académico

Intereses de investigación

• Caracterización de comunidades microbianas en sistemas de remediación
• Genómica y metagenómica en ambientes hipersalinos
• Microbiología molecular en la rizosfera de cactus en zonas semiáridas
• Metagenómica microbiana en corales con síndrome blanco
• Diversidad y estructura de comunidades microbianas en especies acuáticas

Trabajo Académico

En las páginas siguientes puede consultar el trabajo de investigación:






Algunos ejemplos de publicaciones

Seleccione la referencia bibliografica para consultar cada publicación:


Open Access Referencias ODS ONU
López-Pérez, M., Aguirre-Garrido, J.F., Herrera-Zúñiga, L. and 1 more (...) (2024).Structure, expression regulation, and applications of fungal laccases, an interesting prospective in biotechnology. Studies in Natural Products Chemistry,80227-267
Cuetero-Martínez, Y., de los Cobos-Vasconcelos, D., Aguirre-Garrido, J.F. and 2 more (...) (2023).Next-generation Sequencing for Surveillance of Antimicrobial Resistance and Pathogenicity in Municipal Wastewater Treatment Plants. Current Medicinal Chemistry,30(1) 5-29| 3| 6| 11 |
Cuetero-Martínez, Y., Villamizar-Ojeda, K.N., Hernández-Santiago, M.J. and 4 more (...) (2023).Removal of intI1, ARGs, and SARS-CoV-2 and changes in bacterial communities in four sewage treatment facilities. Science of the Total Environment,903| 3| 6| 11 |
OADe Sales-Millán, A., Aguirre-Garrido, J.F., González-Cervantes, R.M. and 1 more (...) (2023).Microbiome–Gut–Mucosal–Immune–Brain Axis and Autism Spectrum Disorder (ASD): A Novel Proposal of the Role of the Gut Microbiome in ASD Aetiology. Behavioral Sciences,13(7)
OAHernández-Soto, L.M., Martínez-Abarca, F., Ramírez-Saad, H. and 2 more (...) (2023).Genome analysis of haloalkaline isolates from the soda saline crater lake of Isabel Island; comparative genomics and potential metabolic analysis within the genus Halomonas. BMC Genomics,24(1) | 6 |
OACuetero-Martínez, Y., Monroy-Hermosillo, O., Aguirre-Garrido, J.F. and 2 more (...) (2023).Changes in the prokaryotic communities occurring along a two-stage anaerobic digestion system treating the organic fraction of solid waste. Journal of Hazardous Materials Advances,12| 6| 11| 12 |
Ramírez-Moreno, F.J., Gómez-Oliván, L.M., Islas-Flores, H. and 3 more (...) (2023).A comprehensive approach to how hospital effluents lead to oxidative stress and shift the gene expression in target organs of Danio rerio. Science of the Total Environment,887| 6 |
Cuetero-Martínez, Y., Flores-Ramírez, A., De los Cobos-Vasconcelos, D. and 3 more (...) (2023).Removal of bacterial pathogens and antibiotic resistance bacteria by anaerobic sludge digestion with thermal hydrolysis pre-treatment and alkaline stabilization post-treatment. Chemosphere,313| 3| 6 |
OAAguilar-Vilchis, R., Hernández-Rodríguez, I.A., González-Blanco, G. and 3 more (...) (2023).Characterization of sediments from the upper basin of the Lerma River, Mexico: Microbiome and biomethane potential. Revista Mexicana de Ingeniera Quimica,22(2) | 6 |
Cienfuegos-Martínez, K., Monroy-Dosta, M.D.C., Hamdan-Partida, A. and 3 more (...) (2022).Effect of the probiotic Lactococcus lactis on the microbial composition in the water and the gut of freshwater prawn (Macrobrachium rosenbergii) cultivate in biofloc. Aquaculture Research,53(11) 3877-3889| 14 |
Hernández-Rodríguez, I.A., González-Blanco, G., Aguirre-Garrido, J.F. and 1 more (...) (2022).An Intensified Hybrid Constructed Wetland for Polluted Channel Water Treatment. Water, Air, and Soil Pollution,233(3) | 6 |
OAMartínez-Carrillo, B.E., Mondragón-Velásquez, T., Ramírez-Durán, N. and 4 more (...) (2022).Changes in Metabolic Regulation and the Microbiota Composition after Supplementation with Different Fatty Acids in db/db Mice. International Journal of Food Science,2022
OASánchez y Sánchez de la Barquera, B., Martínez Carrillo, B.E., Aguirre Garrido, J.F. and 4 more (...) (2022).Emerging Evidence on the Use of Probiotics and Prebiotics to Improve the Gut Microbiota of Older Adults with Frailty Syndrome: A Narrative Review. Journal of Nutrition, Health and Aging,26(10) 926-935
OAGonzález-Blanco, G., Casas-Reyes, A., Velasco-Garduño, O. and 3 more (...) (2021).Simultaneous nitrification/denitrification and desulfurization of wastewater polluted with ammonium, COD and sulfide: effectiveness of a new up-flow vertical hybrid reactor. 3 Biotech,11(3) | 6 |
Guzmán-Mejía, F., Vega-Bautista, A., Molotla-Torres, D.E. and 2 more (...) (2021).Bovine lactoferrin as a Modulator of Neuroendocrine Components of Stress. Current Molecular Pharmacology,14(6) 1037-1045| 3 |
OAEscoto, J.A., Martínez-Carrillo, B.E., Ramírez-Durán, N. and 3 more (...) (2021).Chronic consumption of sweeteners in mice; effect on immune system and microbiota of small intestine. Biomedica,41(3) 1-61
OAGonzález-Blanco, G., Pérez-Pérez, V., Aguirre-Garrido, J.F. and 2 more (...) (2020).Kinetics and microbial structure of nitrogen cycle bacteria contained in the rhizosphere of natural wetland polluted with chromium. Revista Mexicana de Ingeniera Quimica,19(2) 543-553| 6 |
Aguirre-Garrido, J.F., Martínez-Abarca, F., Montiel-Lugo, D. and 2 more (...) (2020).Metagenomic analyses uncover the differential effect of azide treatment on bacterial community structure by enriching a specific Cyanobacteria present in a saline-alkaline environmental sample. International Microbiology,23(3) 467-474
OAde la Torre-Hernández, M.E., Salinas-Virgen, L.I., Aguirre-Garrido, J.F. and 4 more (...) (2020).Composition, Structure, and PGPR Traits of the Rhizospheric Bacterial Communities Associated With Wild and Cultivated Echinocactus platyacanthus and Neobuxbaumia polylopha. Frontiers in Microbiology,11
OAVázquez-Silva, G., Ramírez-Saad, H.C., Aguirre-Garrido, J.F. and 3 more (...) (2017).Effect of bacterial probiotics bio-encapsulated into artemia franciscana on weight and length of the shortfin silverside (Chirostoma humboldtianum), and pcr-dgge characterization of its intestinal bacterial community. Latin American Journal of Aquatic Research,45(5) 1031-1043| 14 |
OASánchez-Marañón, M., Miralles, I., Aguirre-Garrido, J.F. and 6 more (...) (2017).Changes in the soil bacterial community along a pedogenic gradient. Scientific Reports,7(1)
Aguirre-Garrido, J.F., Ramírez-Saad, H.C., Toro, N. and 1 more (...) (2016).Bacterial Diversity in the Soda Saline Crater Lake from Isabel Island, Mexico. Microbial Ecology,71(1) 68-77
Ortega-González, D.K., Zaragoza, D., Aguirre-Garrido, J. and 3 more (...) (2013).Degradation of benzene, toluene, and xylene isomers by a bacterial consortium obtained from rhizosphere soil of Cyperus sp. grown in a petroleum-contaminated area. Folia Microbiologica,58(6) 569-577| 6 |

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Cursos impartidos

No.Trim.Nombre UEANivel
1
23O
Ecología MicrobianaLicenciatura
2
23O
EcotoxicologíaLicenciatura
3
23O
Instrumentos RemedialesLicenciatura
4
23O
Proyecto de Investigación IPosgrado
5
23O
Seminario de Investigación IPosgrado
6
23O
Seminario IIIPosgrado
7
23O
Trabajo de Investigación IIIPosgrado
8
23O
Seminario IVPosgrado
9
23O
Trabajo de Investigación IVPosgrado
10
23O
Seminario VIPosgrado
11
23O
Trabajo de Investigación VIPosgrado
12
23O
Trabajo de Investigación VIIIPosgrado
13
23P
MicrobiologíaLicenciatura
14
23P
Seminario de Temas Selectos de Biología de la ConservaciónLicenciatura
15
23P
Proyecto Terminal de Psicología Biomédica IILicenciatura
16
23P
Temas Selectos en Ecología y Medio Ambiente IIPosgrado
17
23P
Seminario IIPosgrado
18
23P
Trabajo de Investigación IIPosgrado
19
23P
Seminario IIIPosgrado
20
23P
Trabajo de Investigación IIIPosgrado
21
23P
Seminario VPosgrado
22
23P
Trabajo de Investigación VPosgrado
23
23P
Trabajo de Investigación VIIPosgrado
24
23I
Tópicos Selectos Interdisciplinarios IIILicenciatura
25
23I
Ecología MicrobianaLicenciatura
26
23I
EcotoxicologíaLicenciatura
27
23I
Instrumentos RemedialesLicenciatura
28
23I
Proyecto Terminal de Psicología Biomédica ILicenciatura
29
23I
Temas Selectos InterdIVisionales IVLicenciatura
30
23I
La Comunicación en Las Ciencias y Tecnologías AgropecuariasPosgrado
31
23I
Seminario IIPosgrado
32
23I
Trabajo de Investigación IIPosgrado
33
23I
Seminario IPosgrado
34
23I
Trabajo de Investigación IPosgrado
35
23I
Seminario IVPosgrado
36
23I
Trabajo de Investigación IVPosgrado
37
23I
Seminario VIPosgrado
38
23I
Trabajo de Investigación VIPosgrado
39
22O
Taller Optativo Interdivisional IILicenciatura
40
22O
Taller Optativo Interdivisional VIILicenciatura
41
22O
Taller Optativo Interdivisional XLicenciatura
42
22O
Tópicos Selectos Interdisciplinarios IVLicenciatura
43
22O
Ecología MicrobianaLicenciatura
44
22O
EcotoxicologíaLicenciatura
45
22O
Instrumentos RemedialesLicenciatura
46
22O
Seminario IPosgrado
47
22O
Trabajo de Investigación IPosgrado
48
22O
Trabajo de Investigación IPosgrado
49
22O
Seminario de Avances de Investigación IIPosgrado
50
22O
Seminario IIIPosgrado
51
22O
Trabajo de Investigación IIIPosgrado
52
22O
Seminario VPosgrado
53
22O
Trabajo de Investigación VPosgrado
54
22O
Trabajo de Redacción de Tesis IIIPosgrado
55
22P
Temas Selectos Interdivisionales IIILicenciatura
56
22P
Temas Selectos InterdIVisionales IVLicenciatura
57
22P
MicrobiologíaLicenciatura
58
22P
Tópicos Selectos Interdisciplinarios IIILicenciatura
59
22P
Tópicos Selectos Interdisciplinarios IIILicenciatura
60
22P
Tópicos Selectos Interdisciplinarios IVLicenciatura
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