Trabajo Académico

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Incidencia en los ODS ONU

Intereses de investigación

• Caracterización de comunidades microbianas en sistemas de remediación
• Genómica y metagenómica en ambientes hipersalinos
• Microbiología molecular en la rizosfera de cactus en zonas semiáridas
• Metagenómica microbiana en corales con síndrome blanco
• Diversidad y estructura de comunidades microbianas en especies acuáticas

Semblanza

El Doctor Aguirre-Garrido es Profesor Investigador Titular C Tiempo Completo en la Universidad Autónoma Metropolitana, Unidad Lerma, en el departamento de ciencias ambientales. Por su experiencia en investigación y trayectoria académica, el Dr. Aguirre-Garrido es Investigador Nacional Nivel I del Sistema Nacional de Investigadores, nombramiento vigente hasta el 31 diciembre de 2021.

Su trabajo de investigación está soportado por un total de 12 publicaciones, un índice h de 5 y 112 citas según la base de datos Scopus. Es coautor de 2 capítulos de libros, ha presentado cerca de 15 trabajos en eventos académicos internacionales, 20 trabajos en congresos nacionales e impartido dos cursos de bioinformática uno en la Universidad Autónoma del Estado de México y otro en la Universidad Autónoma Metropolitana.

Ha impartido 5 cursos de conservación de ecosistemas marinos e impacto ambiental en la Unidad Lerma en el marco del convenio que sostiene con la ONG Sea Shepherd. En el periodo de enero 2014 a enero de 2015, hizo una estancia postdoctoral en la Estación Experimental del Zaidín dependiente del Centro Superior de Investigaciones Científicas de España, en el grupo de investigación de Estructura, Dinámica y Función de Genomas de Rizobacterias, durante esta estancia se relacionó con la operación del equipo de secuenciación masiva del centro y el análisis bioinformático de los proyectos asignados al grupo de investigación.

La linea de investigación principal del Dr. Aguirre es la caracterización de comunidades microbianas mediante enfoques de microbiología tradicional y molecular en diferentes ambientes.

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Open Access	Referencias	ODS ONU
OA	Salinas-Velarde, I.D., Donaciano-Domínguez, J.M., Oros-Pantoja, R. and 6 more (...) (2025).Narrative Review: Gut Microbiota and Its Impact on α-syn Function in Parkinson's Disease. MicrobiologyOpen,14(6)
OA	Avila-Andrade, A., Beristain-Cardoso, R., García-Mondragón, D. and 3 more (...) (2025).Biodegradation potential of thermophilic cellulolytic bacteria isolated from urban organic waste composting. Revista Mexicana de Ingeniera Quimica,24(3)
OA	Salinas-Virgen, L.I., de la Torre-Hernández, M.E., Aguirre-Garrido, J.F. and 2 more (...) (2024).Genotypic and Phenotypic Characterization of Pseudomonas atacamensis EMP42 a PGPR Strain Obtained from the Rhizosphere of Echinocactus platyacanthus (Sweet Barrel). Microorganisms,12(8)
OA	González-García, S., Hamdan-Partida, A., Pérez-Ramos, J. and 3 more (...) (2024).Comparison of the bacterial microbiome in the pharynx and nasal cavity of persistent, intermittent carriers and non-carriers of Staphylococcus aureus. Journal of Medical Microbiology,73(12)
OA	De Sales-Millán, A., Reyes-Ferreira, P., Aguirre-Garrido, J.F. and 3 more (...) (2024).Comprehensive Analysis of Gut Microbiota Composition and Functional Metabolism in Children with Autism Spectrum Disorder and Neurotypical Children: Implications for Sex-Based Differences and Metabolic Dysregulation. International Journal of Molecular Sciences,25(12)
OA	González, C.Y., Estrada, J.A., Oros-Pantoja, R. and 4 more (...) (2024).The Gut Microbiota Is Involved in the Regulation of Cognitive Flexibility in Adolescent BALB/c Mice Exposed to Chronic Physical Stress and a High-Fat Diet. Microorganisms,12(12)
OA	González-Velázquez, G., Aguirre-Garrido, J.F., Oros-Pantoja, R. and 4 more (...) (2024).Supplementation with inulin reverses cognitive flexibility alterations and modulates the gut microbiota in high-fat-fed mice. Frontiers in Behavioral Neuroscience,18
	López-Pérez, M., Aguirre-Garrido, J.F., Herrera-Zúñiga, L. and 1 more (...) (2024).Structure, expression regulation, and applications of fungal laccases, an interesting prospective in biotechnology. Studies in Natural Products Chemistry,80227-267
OA	Martínez-Carrillo, B.E., De Sales-Millán, A., Aguirre-Garrido, J.F. and 3 more (...) (2024).Changes in the Composition and Diversity of the Intestinal Microbiota Associated with Carbohydrate Consumption in Type 2 Diabetes Mellitus Patients. International Journal of Molecular Sciences,25(22)	\| 3 \|
OA	De Sales-Millán, A., Aguirre-Garrido, J.F., González-Cervantes, R.M. and 1 more (...) (2023).Microbiome–Gut–Mucosal–Immune–Brain Axis and Autism Spectrum Disorder (ASD): A Novel Proposal of the Role of the Gut Microbiome in ASD Aetiology. Behavioral Sciences,13(7)
OA	Cuetero-Martínez, Y., Monroy-Hermosillo, O., Aguirre-Garrido, J.F. and 2 more (...) (2023).Changes in the prokaryotic communities occurring along a two-stage anaerobic digestion system treating the organic fraction of solid waste. Journal of Hazardous Materials Advances,12	\| 6\| 11\| 12 \|
	Cuetero-Martínez, Y., de los Cobos-Vasconcelos, D., Aguirre-Garrido, J.F. and 2 more (...) (2023).Next-generation Sequencing for Surveillance of Antimicrobial Resistance and Pathogenicity in Municipal Wastewater Treatment Plants. Current Medicinal Chemistry,30(1) 5-29	\| 3\| 6\| 11 \|
	Cuetero-Martínez, Y., Villamizar-Ojeda, K.N., Hernández-Santiago, M.J. and 4 more (...) (2023).Removal of intI1, ARGs, and SARS-CoV-2 and changes in bacterial communities in four sewage treatment facilities. Science of the Total Environment,903	\| 3\| 6\| 11 \|
	Cuetero-Martínez, Y., Flores-Ramírez, A., De los Cobos-Vasconcelos, D. and 3 more (...) (2023).Removal of bacterial pathogens and antibiotic resistance bacteria by anaerobic sludge digestion with thermal hydrolysis pre-treatment and alkaline stabilization post-treatment. Chemosphere,313	\| 3\| 6 \|
OA	Hernández-Soto, L.M., Martínez-Abarca, F., Ramírez-Saad, H. and 2 more (...) (2023).Genome analysis of haloalkaline isolates from the soda saline crater lake of Isabel Island; comparative genomics and potential metabolic analysis within the genus Halomonas. BMC Genomics,24(1)	\| 6 \|
OA	Aguilar-Vilchis, R., Hernández-Rodríguez, I.A., González-Blanco, G. and 3 more (...) (2023).Characterization of sediments from the upper basin of the Lerma River, Mexico: Microbiome and biomethane potential. Revista Mexicana de Ingeniera Quimica,22(2)	\| 6 \|
	Ramírez-Moreno, F.J., Gómez-Oliván, L.M., Islas-Flores, H. and 3 more (...) (2023).A comprehensive approach to how hospital effluents lead to oxidative stress and shift the gene expression in target organs of Danio rerio. Science of the Total Environment,887	\| 6 \|
OA	Sánchez y Sánchez de la Barquera, B., Martínez Carrillo, B.E., Aguirre Garrido, J.F. and 4 more (...) (2022).Emerging Evidence on the Use of Probiotics and Prebiotics to Improve the Gut Microbiota of Older Adults with Frailty Syndrome: A Narrative Review. Journal of Nutrition, Health and Aging,26(10) 926-935
OA	Martínez-Carrillo, B.E., Mondragón-Velásquez, T., Ramírez-Durán, N. and 4 more (...) (2022).Changes in Metabolic Regulation and the Microbiota Composition after Supplementation with Different Fatty Acids in db/db Mice. International Journal of Food Science,2022
	Cienfuegos-Martínez, K., Monroy-Dosta, M.D.C., Hamdan-Partida, A. and 3 more (...) (2022).Effect of the probiotic Lactococcus lactis on the microbial composition in the water and the gut of freshwater prawn (Macrobrachium rosenbergii) cultivate in biofloc. Aquaculture Research,53(11) 3877-3889	\| 14 \|
	Hernández-Rodríguez, I.A., González-Blanco, G., Aguirre-Garrido, J.F. and 1 more (...) (2022).An Intensified Hybrid Constructed Wetland for Polluted Channel Water Treatment. Water, Air, and Soil Pollution,233(3)	\| 6 \|
OA	Escoto, J.A., Martínez-Carrillo, B.E., Ramírez-Durán, N. and 3 more (...) (2021).Chronic consumption of sweeteners in mice; effect on immune system and microbiota of small intestine. Biomedica,41(3) 1-61
OA	González-Blanco, G., Casas-Reyes, A., Velasco-Garduño, O. and 3 more (...) (2021).Simultaneous nitrification/denitrification and desulfurization of wastewater polluted with ammonium, COD and sulfide: effectiveness of a new up-flow vertical hybrid reactor. 3 Biotech,11(3)	\| 6 \|
	Guzmán-Mejía, F., Vega-Bautista, A., Molotla-Torres, D.E. and 2 more (...) (2021).Bovine lactoferrin as a Modulator of Neuroendocrine Components of Stress. Current Molecular Pharmacology,14(6) 1037-1045	\| 3 \|
OA	González-Blanco, G., Pérez-Pérez, V., Aguirre-Garrido, J.F. and 2 more (...) (2020).Kinetics and microbial structure of nitrogen cycle bacteria contained in the rhizosphere of natural wetland polluted with chromium. Revista Mexicana de Ingeniera Quimica,19(2) 543-553	\| 6 \|
OA	de la Torre-Hernández, M.E., Salinas-Virgen, L.I., Aguirre-Garrido, J.F. and 4 more (...) (2020).Composition, Structure, and PGPR Traits of the Rhizospheric Bacterial Communities Associated With Wild and Cultivated Echinocactus platyacanthus and Neobuxbaumia polylopha. Frontiers in Microbiology,11
	Aguirre-Garrido, J.F., Martínez-Abarca, F., Montiel-Lugo, D. and 2 more (...) (2020).Metagenomic analyses uncover the differential effect of azide treatment on bacterial community structure by enriching a specific Cyanobacteria present in a saline-alkaline environmental sample. International Microbiology,23(3) 467-474

Cursos impartidos en los últimos trimestres

No.	Trim.	Nombre UEA	Nivel
1	25O	Temas Selectos en Ciencias Naturales II	Licenciatura
2	25O	Temas Selectos en Ciencias Naturales I	Licenciatura
3	25O	Seminario VII	Posgrado
4	25O	Trabajo de Redacción de Tesis III	Posgrado
5	25O	Trabajo de Investigación IX	Posgrado
6	25O	Trabajo de Investigación IV	Posgrado
7	25O	Trabajo de Investigación IV	Posgrado
8	25O	Seminario IV	Posgrado
9	25O	Seminario IV	Posgrado
10	25O	Pedagogía y Didáctica Universitaria	Licenciatura
11	25O	Eje Integrador V: Practicas Profesionales	Licenciatura
12	25O	Teoría de Juegos Evolutiva	Licenciatura
13	25O	Teoría de Juegos Evolutiva	Licenciatura
14	25O	Instrumentos Remediales	Licenciatura
15	25O	Ecotoxicología	Licenciatura
16	25O	Análisis Económico	Licenciatura
17	25O	Análisis Económico	Licenciatura
18	25O	Física	Licenciatura
19	25O	Pedagogía y Didáctica Universitaria	Licenciatura
20	25P	Temas Selectos Interdivisionales VII	Licenciatura
21	25P	Planeación Estratégica	Licenciatura
22	25P	Taller Optativo Interdivisional II	Licenciatura
23	25P	Seminario III	Posgrado
24	25P	Seminario III	Posgrado
25	25P	Trabajo de Investigación III	Posgrado
26	25P	Trabajo de Investigación VIII	Posgrado
27	25P	Trabajo de Investigación IX	Posgrado
28	25P	Trabajo de Redacción de Tesis II	Posgrado
29	25P	Seminario VII	Posgrado
30	25P	Taller Optativo Interdivisional VII	Licenciatura
31	25P	Taller Optativo Interdivisional V	Licenciatura
32	25P	Bases Biológicas de la Conducta	Licenciatura
33	25P	Temas Selectos Interdivisionales en Ciencia y Tecnología de Alimentos IV	Licenciatura
34	25P	Tópicos Selectos Interdisciplinarios VI	Licenciatura
35	25P	Tópicos Selectos Interdisciplinarios IV	Licenciatura
36	25P	Principios de la Cooperación Humana	Licenciatura
37	25P	Microbiología	Licenciatura
38	25P	Proyecto Terminal I	Licenciatura
39	25P	Taller Optativo Interdivisional VIII	Licenciatura
40	25I	Seminario II	Posgrado
41	25I	Trabajo de Redacción de Tesis III	Posgrado
42	25I	Trabajo de Redacción de Tesis I	Posgrado
43	25I	Trabajo de Investigación VIII	Posgrado
44	25I	Trabajo de Investigación VII	Posgrado
45	25I	Trabajo de Investigación II	Posgrado
46	25I	Proyecto de Investigación III	Posgrado
47	25I	Trabajo Experimental III	Posgrado
48	25I	Taller de Temas Selectos de Biología de la Conservación	Licenciatura
49	25I	Ecología Microbiana	Licenciatura
50	25I	Proyecto Terminal III	Licenciatura
51	25I	Proyecto Terminal II	Licenciatura
52	24O	Proyecto Terminal I	Licenciatura
53	24O	Temas Selectos InterdIVisionales IV	Licenciatura
54	24O	Física	Licenciatura
55	24O	Tópicos Selectos Interdisciplinarios III	Licenciatura
56	24O	Ecotoxicología	Licenciatura
57	24O	Instrumentos Remediales	Licenciatura
58	24O	Seminario de Temas Selectos de Biología de la Conservación	Licenciatura
59	24O	Trabajo Experimental II	Posgrado
60	24O	Seminario II	Posgrado

Información proporcionada por la Dirección de Sistemas Escolares

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