El Doctor Flores Pedroche obtuvo el grado de biólogo en 1978, el de maestro en ciencias en 1981 y el de doctor en 1998, todos ellos por la Facultad de Ciencias de la UNAM. Realizó una estancia por cinco años en la Universidad de California en Berkeley, donde desarrolló su trabajo de investigación para obtener este último grado.

Fue miembro de la Facultad de Ciencias, UNAM como ayudante de profesor (1977-1978). Becario de Maestría (1978-1981) y de Doctorado (1981-1983) del Programa PSPA (Programa de Superación de Personal Académico) de la UNAM. Profesor de tiempo completo de la Universidad Autónoma Metropolitana (UAM), en el Departamento de Hidrobiología, División Ciencias Biológicas y de la Salud (CBS), Unidad Iztapalapa (1983-2009) y en el Departamento de Ciencias Ambientales, División Ciencias Biológicas y de la Salud (CBS) Unidad Lerma (2009 a la fecha ).

Profesor Titular T.C. “C” Desde 1993, es Research Associate del University Herbarium, University of California at Berkeley. Fue becario OEA en el Programa PRA (1993-1995) y Visiting Scholar, University Herbaria, UC-Berkeley (1993-1998). Sus campos de especialidad son: Ficología. Sistemática filogenética, taxonomía y nomenclatura.

En la UAM Unidad Iztapalapa fundó el laboratorio de Ficología Marina en la División de CBS, así como la Revista Hidrobiológica. Formalizó la línea de Sistemática Filogenética y Molecular en el estudio de las algas marinas, publicando el primer trabajo mexicano en estas áreas de conocimiento. En 1999 ingresó como miembro del Bureau of Nomenclature (Algae) de la International Association of Plant Taxonomy (IAPT), puesto que ha mantenido hasta la fecha. Fue Vicepresidente de la Sociedad Ficológica de América Latina y el Caribe (SOFILAC) durante 2012 y Presidente de la misma asociación desde 2013 hasta 2015. Fungió como Presidente de la Sociedad Mexicana de Ficología (SOMFICO) (2014-2016) y Miembro del Consejo Directivo de la International Phycological Society (IPS) (2016-2018).

Miembro del SNI nivel 1 (2011-2021). Profesor perfil PROMEP (2004-2018) y Responsable del Cuerpo Académico "Ficología Sistemática" PRODEP (2006-2020). Miembro Regular de la Academia Mexicana de Ciencias (2017 a la fecha).

En la gestión académica, ha sido Coordinador de la Licenciatura en Biología (1984), Secretario Académico (1985-1986), Jefe del Departamento de Hidrobiología (1986-1990), Secretario Académico (2004-2006) y Director (2006-2009), todo esto en la División de CBS de la UAM Unidad Iztapalapa. Fue el Rector fundador de la Unidad Lerma de la UAM (2009-2013) y desde entonces su adscripción es en el Departamento de Ciencias Ambientales, CBS de esta Unidad universitaria.

Su producción contempla: publicaciones científicas (72), arbitraje de artículos y libros (97), ponencias en eventos científicos nacionales e internacionales (115), cursos impartidos a nivel licenciatura y posgrado (170), tesis dirigidas (15), conferencias (24), notas y artículos de difusión (22).

Ha participado en la formación de algunos de los ficólogos más importantes de México, la mayoría actualmente miembros del SNI. En la docencia, en colaboración con otros profesores, diseñó la Licenciatura en Hidrobiología, programa vigente de la UAM. En 2010 y bajo su rectoría se propuso un modelo educativo innovador como sustento para la consolidación de la Unidad Lerma de la UAM.