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Perfil investigador
Eng
Dr. José Alejandre Ramírez

Profesor Titular de Carrera Nivel C de Tiempo Completo
Departamento de Química

División de Ciencias Básicas e Ingeniería


Nivel III
del
SNII.
Área I Físico Matemáticas y Ciencias de la Tierra



Unidad Iztapalapa

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Sitios de interés

• Ficha en la Unidad

Incidencia en los ODS ONU

• 3 Salud y bienestar

• 4 Educación de calidad

• 7 Energía asequible y no contaminante


Intereses de investigación

• Desarrollo de campos de fuerza
• Electrolitos para dispositivos almacenadores de energía
• Solventes para mejorar la solubilidad de ingredientes activos
• Simulación mesoscópica bicapa/agua/proteína/IFA/iones

Semblanza

El Dr. José Alejandre Ramírez es Doctor, Maestro y Licenciado por la Universidad Autónoma Metropolitana Unidad Iztapalapa. Ha realizado estancias sabáticas en la University of Southampton, Inglaterra (dos años), el Instituto Mexicano del Petróleo (un año) y la University of Cambridge, Inglaterra (un año).

Es Profesor Investigador Titular de Tiempo Completo en la Universidad Autónoma Metropolitana Unidad Iztapalapa, donde se ha desempeñado como Jefe del Departamento de Química. Es Investigador Nacional Emérito en el Sistema Nacional de Investigadoras e Investigadores (SNII).

Ha impartido conferencias en foros nacionales e internacionales y cuenta con 100 artículos de investigación publicados en revistas especializadas, acumulando más de 6,350 citas (índice h de 37 en Google Scholar) y posicionando dos de sus publicaciones entre las más leídas de autores mexicanos según el American Institute of Physics. En la formación de recursos humanos, ha dirigido a 20 alumnos de licenciatura, 11 de maestría y 9 de doctorado, además de recibir en su grupo a tres posdoctorantes, cuatro investigadores en estancia sabática y un profesor curricular. Ha liderado proyectos de desarrollo con Unilever (Inglaterra), el Instituto Mexicano del Petróleo y el Centro de Investigación en Polímeros-COMEX.

Pionero en la promoción de la simulación molecular en México, ha sido coorganizador de 14 Talleres de Dinámica Molecular a nivel nacional y 15 Meetings on Molecular Simulations a nivel internacional. Algoritmos matemáticos desarrollados por su grupo han sido implementados en programas de simulación de uso global como GROMACS (Países Bajos), LAMMPS (Estados Unidos) y DL_MESO (Inglaterra). Su investigación busca comprender el efecto de las interacciones moleculares en las propiedades fisicoquímicas de la materia, enfocándose en:

1. Métodos de dinámica molecular, Monte Carlo y dinámica de partículas disipativas.
2. Campos de fuerza no polarizables para líquidos polares, líquidos iónicos y sólidos.
3. Electrolitos para mejorar la conductividad iónica en dispositivos de almacenamiento de energía (iones litio y otros metales) mediante solventes polares, líquidos iónicos y polímeros.
4. Solventes para incrementar la solubilidad y liberación de fármacos en agua empleando cocristales y líquidos iónicos a temperatura ambiente.
5. Estudios del transporte de fármacos e iones en membranas lipídicas y proteínas a nivel mesoscópico.
6. Métodos para la extracción de compuestos contaminantes en gasolinas y diésel.


Información proporcionada por el personal académico

Intereses de investigación

• Desarrollo de campos de fuerza
• Electrolitos para dispositivos almacenadores de energía
• Solventes para mejorar la solubilidad de ingredientes activos
• Simulación mesoscópica bicapa/agua/proteína/IFA/iones

Trabajo Académico

En las páginas siguientes puede consultar el trabajo de investigación:



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Algunos ejemplos de publicaciones

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Open Access Referencias ODS ONU
Salas, F.J., Núñez-Rojas, E., Alejandre, J. (2025).Parameterization of phenol, benzoic acid and phenolic acids to obtain their solubility in water. Journal of Molecular Liquids,427
OACarmona-Espíndola, J., García-Melgarejo, V., Núñez-Rojas, E. and 4 more (...) (2024).ADCHα-I population analysis and constrained dipole moment density functional theory in force fields for molecular simulations. Journal of Chemical Physics,161(14)
OASamaniego-Rojas, J.D., Gaumard, R., Alejandre, J. and 3 more (...) (2024).A molecular mechanics implementation of the cyclic cluster model. Zeitschrift fur Naturforschung - Section B Journal of Chemical Sciences,79(4) 201-213
Pozos-García, J., Núñez-Rojas, E., Luis Quiroz-Fabián, J. and 2 more (...) (2024).Efficient search of molecular interaction parameters for polar liquids. Molecular Physics,122(19-20)
OANúñez-Rojas, E., Luz, A.P.L., Saint-Martin, H. and 1 more (...) (2024).Fifty Years of Molecular Simulations at UAM and in Mexico. Journal of the Mexican Chemical Society,68(4) 717-742
Ferrer-Guadalupe, M., Duarte-Mendoza, J., Mendoza-Ambrosio, F.N. and 1 more (...) (2024).Absorption of active pharmaceutical ingredients in a protein/lipid bilayer by dissipative particle dynamics. Molecular Physics,122(21-22)
Núñez-Rojas, E., Alarcón, K.G., Alejandre, J. (2024).Extraction of N- and S-compounds in gasoline and diesel from ionic liquids: A molecular dynamics study. Journal of Molecular Liquids,397
Núñez-Rojas, E., González, I., Guzmán-González, G. and 1 more (...) (2023).Molecular dynamics simulations for liquid electrolytes of propylene carbonate with LiTFSI, LiPF6, and LiBF4 salts. Journal of Molecular Liquids,390| 7 |
Prado-Arroyo, J.L., García-Melgarejo, V., Alejandre, J. (2023).Transferable united atom model for carbohydrates with explicit water: Glucose and sucrose. Journal of Molecular Liquids,385
Samaniego-Rojas, J.D., Hernández-Segura, L.-I., López-Sosa, L. and 11 more (...) (2022).Chapter 1: QM/MM with Auxiliary DFT in deMon2k. RSC Theoretical and Computational Chemistry Series,2022-(22) 1-54
Vargas-Olvera, E.C., Salas-Sánchez, F.J., Colin-Molina, A. and 6 more (...) (2022).Molecular Dynamics Studies of Aromatic Guests in Three Isostructural Inclusion Compounds with Molecular Boron–Nitrogen Hosts. Crystal Growth and Design,22(1) 570-584
García-Melgarejo, V., Núñez-Rojas, E., Alejandre, J. (2021).United atom model via interactions with explicit water (UAMI-EW): Alcohols and ketones. Journal of Molecular Liquids,323
Martínez-Jiménez, M., Serrano-Ocaña, M., Alejandre, J. (2021).United atom model for ionic liquids: UAM-IL. Journal of Molecular Liquids,329
Zárate, J.A., Domínguez-Ojeda, E., Sánchez-González, E. and 6 more (...) (2020).Reversible and efficient SO2capture by a chemically stable MOF CAU-10: Experiments and simulations. Dalton Transactions,49(27) 9203-9207
Carmona-Espíndola, J., Núñez-Rojas, E., Garciá-Melgarejo, V. and 2 more (...) (2020).Constrained dipole moment density functional theory for charge distributions in force fields for the study of molecular fluids. Journal of Chemical Physics,152(12)
García-Melgarejo, V., Alejandre, J., Núñez-Rojas, E. (2020).Parametrization with Explicit Water of Solvents Used in Lithium-Ion Batteries: Cyclic Carbonates and Linear Ethers. Journal of Physical Chemistry B,124(23) 4741-4750| 7 |

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