Trabajo Académico

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Incidencia en los ODS ONU

Intereses de investigación

• Molecular Dynamics and Monte Carlo
• Development of force fields
• Polar and ionic solvents
• Extraction of contaminants in hydrocarbons
• Solubility of drugs in water

Semblanza

El Profesor José Alejandre Ramírez estudió la Licenciatura, Maestría y Doctorado en la Universidad Autónoma Metropolitana (UAM) Unidad Iztapalapa. Ha hecho estancias sabáticas en la Universidad de Southampton, Inglaterra (2 años), Instituto Mexicano del Petróleo (1 año) y Universidad de Cambridge, Inglaterra (1 año). Ha sido jefe del departamento de Química y pertenece al Sistema Nacional de Investigadores en el nivel III.

Ha impartido conferencias en foros nacionales e internacionales y ha publicado 91 artículos de investigación en revistas especializadas. Tiene más de 4600 citas a sus trabajos, de acuerdo a Google Scholar con un índice H de 35 y tiene dos artículos de autores mexicanos más leídos de acuerdo con el American Institute of Physics. Ha dirigido a 15 alumnos de licenciatura, nueve de maestría y ocho de doctorado. Ha recibido en su grupo de investigación a tres posdoctorantes, cuatro sabáticos y a un professor curricular. Ha desarrollado proyectos con Unilever (Inglaterra), Instituto Mexicano del Petróleo y Centro de Investigación en Polímeros-COMEX.

Sus líneas de investigación están orientadas a entender el efecto que tienen las interacciones moleculares en las propiedades fisicoquímicas de la materia. Usa los métodos de la química cuántica y simulación molecular para desarrollar :

1 Métodos de dinámica molecular, Monte Carlo y dinámica de partículas disipativas.
2 Campos de fuerza no polarizables de líquidos polares y iónicos así como de sólidos.
3 Electrolitos para mejorar la conductividad iónica en dispositivos para almacenar energía de iones litio y otros
metales usando solventes polares, líquidos iónicos, polímeros y nanotubos de carbono.
4 Solventes para incrementar la solubilidad y liberación de fármacos en agua usando cocristales, líquidos iónicos a
temperatura ambiente, ciclodextrinas y polímeros.
5 Estudios del transporte de fármacos y iones en membranas lipídicas y proteínas a nivel mesoscópico.
6 Métodos para la extracción de compuestos contaminantes en gasolinas y diesel.

Información proporcionada por el personal académico

Intereses de investigación

• Molecular Dynamics and Monte Carlo
• Development of force fields
• Polar and ionic solvents
• Extraction of contaminants in hydrocarbons
• Solubility of drugs in water

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Open Access	Referencias	ODS ONU
	Salas, F.J., Núñez-Rojas, E., Alejandre, J. (2025).Parameterization of phenol, benzoic acid and phenolic acids to obtain their solubility in water. Journal of Molecular Liquids,427
	Pozos-García, J., Núñez-Rojas, E., Luis Quiroz-Fabián, J. and 2 more (...) (2024).Efficient search of molecular interaction parameters for polar liquids. Molecular Physics,122(19-20)
	Ferrer-Guadalupe, M., Duarte-Mendoza, J., Mendoza-Ambrosio, F.N. and 1 more (...) (2024).Absorption of active pharmaceutical ingredients in a protein/lipid bilayer by dissipative particle dynamics. Molecular Physics,122(21-22)
	Núñez-Rojas, E., Alarcón, K.G., Alejandre, J. (2024).Extraction of N- and S-compounds in gasoline and diesel from ionic liquids: A molecular dynamics study. Journal of Molecular Liquids,397
OA	Núñez-Rojas, E., Luz, A.P.L., Saint-Martin, H. and 1 more (...) (2024).Fifty Years of Molecular Simulations at UAM and in Mexico. Journal of the Mexican Chemical Society,68(4) 717-742
OA	Samaniego-Rojas, J.D., Gaumard, R., Alejandre, J. and 3 more (...) (2024).A molecular mechanics implementation of the cyclic cluster model. Zeitschrift fur Naturforschung - Section B Journal of Chemical Sciences,79(4) 201-213
OA	Carmona-Espíndola, J., García-Melgarejo, V., Núñez-Rojas, E. and 4 more (...) (2024).ADCHα-I population analysis and constrained dipole moment density functional theory in force fields for molecular simulations. Journal of Chemical Physics,161(14)
	Núñez-Rojas, E., González, I., Guzmán-González, G. and 1 more (...) (2023).Molecular dynamics simulations for liquid electrolytes of propylene carbonate with LiTFSI, LiPF6, and LiBF4 salts. Journal of Molecular Liquids,390	\| 7 \|
	Prado-Arroyo, J.L., García-Melgarejo, V., Alejandre, J. (2023).Transferable united atom model for carbohydrates with explicit water: Glucose and sucrose. Journal of Molecular Liquids,385
OA	Samaniego-Rojas, J.D., Hernández-Segura, L.-I., López-Sosa, L. and 11 more (...) (2022).Chapter 1: QM/MM with Auxiliary DFT in deMon2k. RSC Theoretical and Computational Chemistry Series,2022-(22) 1-54
	Vargas-Olvera, E.C., Salas-Sánchez, F.J., Colin-Molina, A. and 6 more (...) (2022).Molecular Dynamics Studies of Aromatic Guests in Three Isostructural Inclusion Compounds with Molecular Boron–Nitrogen Hosts. Crystal Growth and Design,22(1) 570-584
	García-Melgarejo, V., Núñez-Rojas, E., Alejandre, J. (2021).United atom model via interactions with explicit water (UAMI-EW): Alcohols and ketones. Journal of Molecular Liquids,323
	Martínez-Jiménez, M., Serrano-Ocaña, M., Alejandre, J. (2021).United atom model for ionic liquids: UAM-IL. Journal of Molecular Liquids,329
	García-Melgarejo, V., Alejandre, J., Núñez-Rojas, E. (2020).Parametrization with Explicit Water of Solvents Used in Lithium-Ion Batteries: Cyclic Carbonates and Linear Ethers. Journal of Physical Chemistry B,124(23) 4741-4750	\| 7 \|
	Carmona-Espíndola, J., Núñez-Rojas, E., Garciá-Melgarejo, V. and 2 more (...) (2020).Constrained dipole moment density functional theory for charge distributions in force fields for the study of molecular fluids. Journal of Chemical Physics,152(12)
	Zárate, J.A., Domínguez-Ojeda, E., Sánchez-González, E. and 6 more (...) (2020).Reversible and efficient SO2capture by a chemically stable MOF CAU-10: Experiments and simulations. Dalton Transactions,49(27) 9203-9207

Cursos impartidos en los últimos trimestres

No.	Trim.	Nombre UEA	Nivel
1	25O	Procesos Dinámicos en Física Molecular I	Posgrado
2	25O	Termodinámica Estadística	Posgrado
3	25O	Fisicoquímica V	Licenciatura
4	25P	Laboratorio de Fisicoquímica Computacional	Licenciatura
5	25P	Introducción al Computo Científico	Posgrado
6	25I	Fisicoquímica V	Licenciatura
7	23P	Laboratorio de Fisicoquímica Computacional	Licenciatura
8	23I	Fisicoquímica Computacional	Posgrado
9	23I	Proyecto Terminal II Fisicoquímica	Licenciatura
10	23I	Proyecto Terminal II Fisicoquímica	Licenciatura
11	23I	Laboratorio de Fisicoquímica Computacional	Licenciatura
12	23I	Transformaciones Químicas	Licenciatura
13	22O	Transformaciones Químicas	Licenciatura
14	22O	Laboratorio de Fisicoquímica Computacional	Licenciatura
15	22O	Métodos de Simulación Molecular	Licenciatura
16	22O	Proyecto Terminal I Fisicoquímica	Licenciatura
17	22O	Proyecto Terminal I Fisicoquímica	Licenciatura
18	22P	Transformaciones Químicas	Licenciatura
19	22P	Laboratorio de Fisicoquímica Computacional	Licenciatura
20	22I	Laboratorio de Fisicoquímica Computacional	Licenciatura
21	22I	Fisicoquímica VII	Licenciatura
22	22I	Métodos de Simulación Molecular	Licenciatura
23	22I	Proyecto Terminal II Fisicoquímica	Licenciatura

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